Константин дудченко статистика: Константин Дудченко (спортсмен, футбол, Украина): новости, биография, статистика спортсмена

Разное

Содержание

Константин Дудченко (спортсмен, футбол, Украина): новости, биография, статистика спортсмена

Константин Дудченко (спортсмен, футбол, Украина): новости, биография, статистика спортсмена | Vesti.kz 3UzTUAbuIlggr9PlXRMxtlgEFNuS6iBtk1QRtE3m Войти через социальную сеть

Пожалуйста, подождите… Укажите email Укажите имя или псевдоним Укажите пароль Для регистрации на сайте Вы должны принять Правила сообщества Для редактирования профиля необходимо авторизоваться на сайте Укажите корректный Email material_dobavlen_v_izbrannoe Добавить в избранное Убрать из избранного Пароли не совпадают Задайте пароль для входа на сайт Хороший пароль должен содержать строчные, заглавные латинские буквы и цифры. Рекомендуется добавлять знаки препинания и задавать длину пароля не менее 8 символов Спасибо за Ваш голос! Добавить +1 Убрать +1 Выберите вариант ответа

Место

Вход на сайт

Войти через социальную сеть:

>

Вид спорта
Футбол
Амплуа
Спортсмен
Действующий
Да
Место рождения
Мелитополь
Дата рождения
8 июля 1986 (35 лет)
Пол
мужской
Рост, см
194
Вес, кг
91

Вся статистика — Первый дивизион сезона 2013/2014 — Первый дивизион — Футбол

МестоГолыИгроки
119

Александр Кутьин (Арсенал Т)

214

Дмитрий Голубов (Уфа)

312

Илья Михалев (Нефтехимик)

411

Алексей Иванов (Мордовия)

510

Антон Бобер (Мордовия)

69

Денис Ткачук (Оренбург), Натан Суарес де Корвалью Джуниор (СКА-Хабаровск), Евгений Савин (Луч), Владислав Рыжков (Арсенал Т)

78

Игорь Шевченко (Торпедо), Владимир Корытько (Шинник), Рустем Мухаметшин (Мордовия), Максим Вотинов (Балтика)

87

Тамаш Пришкин (Алания), Руслан Мухаметшин (Мордовия), Георгий Габулов (Алания), Антон Кобялко (Оренбург), Антон Хазов (Оренбург), Хуан Эдуардо Лескано (Енисей), Павел Деобальд (Шинник), Сергей Игнатьев (Арсенал Т), Алексей Базанов (Арсенал Т)

96

Константин Дудченко (Шинник), Владимир Лешонок (Енисей), Александр Касьян (Химик Дз), Александр Ставпец (Ротор), Дмитрий Акимов (Сочи), Александр Кацалапов (Торпедо), Максим Андреев (Сочи), Артур Малоян (Шинник), Сейт-Даут Гаракоев (Уфа)

105

Шамиль Асильдаров (Луч), Андрей Мурнин (СКА-Хабаровск), Михаил Маркосов (Сибирь), Андрей Михеев (Ротор), Алихан Шаваев (Спартак Нч), Сергей Пятикопов (Енисей), Руслан Зязиков (Ангушт), Хызыр Аппаев (Ротор)

114

Михаил Бирюков (Сочи), Иван Столбовой (Химик Дз), Игорь Горбатенко (Шинник), Андрей Сальников (Балтика), Томас Микуцкис (Торпедо), Евгений Осипов (Уфа), Антон Килин (Уфа), Владислав Никифоров (СКА-Хабаровск), Карлос Андрес Руа (Спартак Нч), Ринат Тимохин (Арсенал Т), Дмитрий Кудряшов (Луч), Дмитрий Рыжов (Енисей), Дмитрий Сысуев (Балтика), Гогита Гогуа (СКА-Хабаровск), Евгений Луценко (Мордовия), Томаш Выходил (Сибирь), Магомед Гугуев (Ангушт), Евгений Чеботару (Сибирь), Мераби Уридия (Нефтехимик), Игорь Коронов (Оренбург), Константин Зимулька (Балтика), Владимир Парняков (Оренбург)

123

Отар Марцваладзе (Алания), Максим Астафьев (Сибирь), Георгий Джиоев (Химик Дз), Игорь Киреев (Спартак Нч), Игорь Ламбарский (Енисей), Владимир Хозин (Алания), Хорен Байрамян (Ротор), Дмитрий Кабутов (Ротор), Артем Бекетов (Салют Бл), Александр Салугин (Торпедо), Никита Саталкин (Оренбург), Дмитрий Смирнов (Арсенал Т), Денис Дорожкин (Луч), Илья Кухарчук (Шинник), Эльдар Низамутдинов (Шинник), Виталий Галыш (Енисей), Вячеслав Сушкин (Сочи), Карлос де Оливейра Диегу (Уфа), Олег Власов (Торпедо), Владимир Есин (Сочи), Сергей Рашевский (Енисей), Иван Маркелов (Сочи), Михаил Маркин (Мордовия), Александр Радченко (СКА-Хабаровск), Антон Архипов (Химик Дз), Антон Заболотный (Уфа), Артур Валикаев (Уфа), Александр Еркин (Химик Дз), Сергей Мирошниченко (Сочи), Станислав Матяш (Сочи), Семен Фомин (Ротор), Максим Скавыш (Балтика), Давид Дзахов (Нефтехимик), Дмитрий Айдов (Торпедо), Лукаш Тесак (Торпедо), Александр Мануковский (Химик Дз), Манучехр Джалилов (Нефтехимик), Алексей Друзин (Оренбург)

132

Данилу Неку (Алания), Роман Косянчук (Нефтехимик), Руслан Корян (Луч), Сергей Самодин (Мордовия), Михаил Гащенков (Химик Дз), Руслан Болов (Спартак Нч), Андрей Панюков (Спартак Нч), Дмитрий Комаровский (Ротор), Даврон Мирзаев (Нефтехимик), Руслан Камболов (Нефтехимик), Алексей Пугин (Ротор), Санжар Турсунов (Оренбург), Вахыт Оразсахедов (Нефтехимик), Мерсудин Ахметович (Салют Бл), Роман Беляев (Сибирь), Даниэле Эстебан Буйтраго (Спартак Нч), Евгений Зиновьев (Сибирь), Георгий Нуров (Нефтехимик), Арсен Гошоков (Спартак Нч), Николай Зайцев (Нефтехимик), Наиль Замалиев (СКА-Хабаровск), Батраз Хадарцев (Алания), Алексей Аверьянов (Луч), Родригес Феррейра Нивалду (Сибирь), Денис Бояринцев (Торпедо), Сергей Бутырин (Салют Бл), Сергей Егоров (Сочи), Александр Минченков (Балтика), Василий Кармазиненко (СКА-Хабаровск), Вячеслав Кренделев (Луч), Сергей Маслов (Арсенал Т), Андрей Киреев (Уфа), Максим Трусевич (СКА-Хабаровск), Акаки Хубутия (Мордовия), Александр Зотов (Шинник), Андрей Лях (Арсенал Т), Максим Плопа (Балтика), Сергей Белоусов (Шинник), Андрей Мязин (Ротор), Иван Нагибин (Уфа), Виталий Каленкович (Балтика), Вальтер Чала (Нефтехимик), Анатолий Романович (Луч), Михаил Багаев (Торпедо), Александр Димидко (Мордовия), Владимир Романенко (Луч), Давид Сирадзе (Спартак Нч), Роман Славнов (СКА-Хабаровск), Абдулхамид Ахильгов (Ангушт), Олег Лайзанс (Енисей), Дмитрий Стоцкий (Балтика), Артур Рылов (Ротор), Максим Васильев (Балтика)

141

Матия Дворнекович (Торпедо), Артем Молодцов (Шинник), Роман Адамов (Сибирь), Денис Вихров (Сочи), Резиуан Мирзов (Торпедо), Давид Цораев (СКА-Хабаровск), Амир Бажев (Спартак Нч), Максим Барсов (Оренбург), Николай Иванников (Оренбург), Тарас Царикаев (Алания), Андрей Васянович (Ротор), Антон Григорьев (Алания), Роман Григорян (Нефтехимик), Владимир Камеш (Нефтехимик), Семен Помогаев (Сочи), Максим Бурченко (Торпедо), Игорь Калешин (Арсенал Т), Валерий Чуперка (Спартак Нч), Дмитрий Кириченко (Мордовия), Дмитрий Отставнов (Нефтехимик), Максим Житнев (Сибирь), Парвизджон Умарбаев (Нефтехимик), Эдгар Гаурачс (Торпедо), Владимир Ильин (Сочи), Виктор Свежов (Торпедо), Александр Харитонов (Енисей), Максим Кирсанов (Сочи), Олег Кожанов (Оренбург), Сергей Кузнецов (Арсенал Т), Ринат Мавлетдинов (Луч), Михаил Сорочкин (Ангушт), Иван Лукьянов (Ротор), Александр Малыгин (Ротор), Александр Яркин (СКА-Хабаровск), Руслан Паштов (Химик Дз), Гуджа Рухаиа (Спартак Нч), Альберт Цховребов (Алания), Ислам Машуков (СКА-Хабаровск), Максим Семакин (Уфа), Алексей Померко (Шинник), Аслан Дудиев (СКА-Хабаровск), Артем Дудолев (Сибирь), Евгений Гапон (Шинник), Валерий Кичин (Уфа), Кирилл Марущак (Енисей), Виталий Запрудских (Балтика), Брайн Оладапо Идову (Сочи), Роман Войдель (Ротор), Андрей Прошин (Химик Дз), Максим Тишкин (Уфа), Ислам Цуроев (Ангушт), Иван Мельник (Сочи), Максим I Лепский (Арсенал Т), Михаил Плэтикэ (Нефтехимик), Ваха Албаков (Ангушт), Азат Байрыев (СКА-Хабаровск), Аслан Дышеков (Ангушт), Николай Жиляев (Уфа), Аслан Засеев (Нефтехимик), Адлан Кацаев (Луч), Владимир Полуяхтов (Оренбург), Вячеслав Чадов (Енисей), Петр Тен (Ротор), Дмитрий Андреев (Оренбург), Аслан Дашаев (Ангушт), Иван Дранников (Нефтехимик), Андрей Пазин (Мордовия), Даниил Гриднев (Нефтехимик), Артур Зюзин (Балтика), Георгий Наваловский (СКА-Хабаровск), Сергей Путилин (Ангушт), Игорь Удалый (СКА-Хабаровск), Сергей Бреев (Оренбург), Григорий Гузь (Ангушт), Евгений Качан (Енисей), Сергей Квасов (Химик Дз), Александр Коротков (Химик Дз), Олег Макеев (Химик Дз), Милан Перендия (Мордовия), Максим Яковлев (Ротор), Сергей Пономаренко (Луч), Денис Клопков (Луч), Вадим Афонин (Оренбург), Павел Аликин (Уфа), Алим Каркаев (Ангушт)

Статистика защитников за год | Корпоративная лига

1Верма Роман Ашутошевич Моспроект-3полузащитник3711
2Иванов Кирилл ВладимировичРоссельхозбанкзащитник2910
3Дроботенко Александр Сергеевич Феникс Контакт РУСполузащитник339
4Шереметьев Андрей НиколаевичРособоронэкспортзащитник339
5Кеменов Денис Дмитриевич Завод ТГИзащитник438
6Селезнев Антон ВитальевичМОКБ Марс ГК Росатомнападающий537
7Юнусов Артур РамилевичРКСзащитник387
8Ряховский Андрей Евгеньевич Завод ТГИзащитник566
9Зямзин Александр Александрович Завод ТГИнападающий546
10Бойков Сергей АлександровичМОКБ Марс ГК Росатомнападающий486
11Князев Кирилл ОлеговичМОКБ Марс ГК Росатомнападающий466
12Финошин Александр Геннадьевич ПСБнападающий466
13Владимиров Роман ВадимовичРосагролизингзащитник376
14Алексеев Антон МаксимовичРосагролизингнападающий366
15Тимохин Михаил Сергеевич ММЗ Авангардзащитник296
16Роганов Матвей ЮрьевичМОКБ Марс ГК Росатомнападающий535
17Кузнецов Сергей ВикторовичМОКБ Марс ГК Росатомвратарь515
18Ли Владислав Олегович Россельхозбанкполузащитник475
19Кочергин Евгений Константинович Моспроект-3полузащитник435
20Лоскутов Алексей ВладимировичФеникс Контакт РУСзащитник375
21Фуртиков Артём Сергеевич ВНИИА защитник375
22Осипов Евгений Алексеевич НПО ПКРВполузащитник345
23Ткаченко Максим МихайловичНПО ПКРВполузащитник345
24Каптелкин Юрий АлександровичРособоронэкспортзащитник335
25Кузнецов Андрей АлександровичBCLPнападающий305
26Онищенко Михаил Александрович МАВ защитник305
27Василенко Глеб АлександровичОнланта защитник175
28Карапетян Артур РафаеловичДом РФполузащитник175
29Блинов Максим АлексеевичРКСнападающий394
30Кантимиров Сергей Александрович BCLPвратарь394
31Ключик Роман Анатольевич Феникс Контакт РУСполузащитник374
32Ковальчук Павел Владимирович НПО ПКРВвратарь344
33Паршин Николай Владимирович Группа РЭЦнападающий324
34Никитин Дмитрий Леонидович ММЗ Авангардзащитник294
35Огуржин Александр Эдуардович МАВ 294
36Гридюшко Денис ОлеговичТСМнападающий284
37Жабин Дмитрий Павлович Моспроект-3защитник274
38Глебов Александр Юрьевич МАВ защитник224
39Караваев Ярослав СергеевичММЗ Авангарднападающий224
40Антошкин Артем Витальевич ВНИИА полузащитник214
41Комаров Роман АлександровичРосагролизингполузащитник164
42Пунченко Антон ВячеславовичМКБнападающий94
43Великий Евгений КонстантиновичЗавод ТГИвратарь543
44Чепелев Семен АлексеевичРоссельхозбанкполузащитник453
45Соловьев Александр Сергеевич ВНИИА полузащитник423
46Давыдов Дмитрий ВалерьевичБанк СОЮЗнападающий353
47Черемухин Вячеслав ВячеславовичРособоронэкспортвратарь353
48Дудченко Александр Александрович Феникс Контакт РУСполузащитник333
49Шаряфетдинов Камиль АбдулганиевичРКСнападающий333
50Ледвин Александр ВикторовичФеникс Контакт РУСвратарь303
51Хурамшин Артем РинатовичHPEполузащитник303
52Мирошкин Алексей Константинович Россельхозбанкполузащитник293
53Жуков Максим ВалерьевичВНИИА полузащитник273
54Горшков Дмитрий Евгеньевич ВНИИА полузащитник263
55Канавин Никита Иванович Рособоронэкспортнападающий193
56Данилков Иван Николаевич Группа Черкизовонападающий173
57Лубянский Владимир ГеоргиевичГАРАНТ Энергополузащитник173
58Сапрунов Виктор ВикторовичГруппа Черкизовонападающий163
59Мануков Артём Станиславович ГАРАНТ Энергозащитник143
60Фролков Андрей Геннадьевич ГАРАНТ Энергозащитник143
61Сверков Алексей АлександровичРосагролизинг-2нападающий133
62Торопкин Константин АлександровичБанкиръполузащитник133
63Лукьянов Фёдор АльбертовичМОКБ Марс ГК Росатомвратарь562
64Михайлов Иван Георгиевич МОКБ Марс ГК Росатомнападающий502
65Фокин Александр Олегович Россельхозбанкполузащитник442
66Аброськин Кузьма ИвановичМОКБ Марс ГК Росатомполузащитник422
67Курочкин Владимир ВладимировичБанк СОЮЗполузащитник422
68Сафонов Константин ЕвгеньевичЗавод ТГИнападающий412
69Егикян Арен ГамлетовичПСБполузащитник372
70Кальчук Владимир НиколаевичРКСвратарь342
71Жубрин Дмитрий МихайловичBCLPзащитник332
72Шипков Илья ВладимировичТСМзащитник332
73Верещак Илья Дмитриевич НПО ПКРВзащитник322
74Котов Андрей Сергеевич ПСБзащитник322
75Гаврилов Павел ВладимировичТСМполузащитник312
76Тюрин Сергей ВикторовичРособоронэкспортзащитник312
77Беляков Денис Александрович ПСБполузащитник302
78Кузнецов Алексей Владимирович Группа РЭЦнападающий302
79Петряков Фёдор ИвановичГруппа РЭЦзащитник302
80Сергеев Алескей Валерьевич ПСБвратарь302
81Васильев Владислав ЮрьевичВНИИА полузащитник272
82Воробьев Александр ВасильевичММЗ Авангардвратарь272
83Будковский Александр ОлеговичМоспроект-3вратарь262
84Поляков Сергей НиколаевичРосагролизингзащитник262
85Пыльнев Иван Серафимович ММЗ Авангарднападающий252
86Свинцов Арсений КонстантиновичММЗ Авангардполузащитник252
87Бокарев Руслан Геннадьевич НТЦ Модульзащитник242
88Буянов Александр АлексеевичРособоронэкспортзащитник242
89Лободин Александр ГеннадьевичТСМзащитник232
90Мамочкин Денис Александрович Росагролизингзащитник222
91Процанов Евгений АлександровичМАВ вратарь212
92Бредус Роман ВадимовичТСМзащитник202
93Лысенко Алексей АлександровичПСБполузащитник202
94Иванов Егор СергеевичBCLPзащитник192
95Булатов Дмитрий Анатольевич ВНИИА полузащитник182
96Варакин Александр Сергеевич ПСБполузащитник182
97Егоров Александр ГеннадьевичРоссельхозбанквратарь182
98Бутин Иван Валентинович ВНИИА вратарь172
99Бычков Александр ВладимировичБанкиръполузащитник172
100Кузнецов Александр ЮрьевичОнланта нападающий172
101Некрасов Андрей ВладимировичРосагролизингнападающий172
102Солодун Павел ЛеонидовичРосагролизинг-2защитник172
103Врона Дмитрий ВладимировичДом РФзащитник162
104Червяков Иван ВалерьевичНПО ПКРВполузащитник152
105Антропов Максим ОлеговичГАРАНТ Энергозащитник142
106Поздеев Антон ВитальевичРосагролизингзащитник142
107Телков Андрей ГеннадьевичПСБнападающий142
108Юдаев Александр ГеннадьевичВНИИА защитник142
109Акелькин Вячеслав ВикторовичОнланта вратарь122
110Ельцов Максим СергеевичБанкиръзащитник112
111Жуков Александр ВячеславовичГУСБзащитник112
112Летучев Владислав АлекссевичРосагролизингзащитник112
113Рева Александр АлександровичБанк Россиивратарь102
114Юнисов Ринат РашидовичБанк Россиизащитник102
115Бровкин Дмитрий ВладимировичФеникс Контакт РУСнападающий92
116Тарасов Юрий АлександровичБанкиръполузащитник92
117Сысоев Андрей ВикторовичГАРАНТ Энергонападающий82
118Коньков Максим НиколаевичБанк Россиизащитник62
119Пронин Александр АлександровичГруппа Черкизововратарь62
120Анисимов Руслан Александрович Ингосстрахнападающий52
121Куратов Александр НиолаевичБМЗвратарь52
122Навалов Сергей Олегович300luxзащитник52
123Поляков Сергей НиколаевичИнгосстрахполузащитник52
124Ярославцев Вячеслав ДмитриевичАЛРОСАзащитник52
125Новиков Виталий АлександровичПересвет 42
126Петров Степан Константинович Россельхозбанкзащитник42
127Гайнулин Эдгар РашидовичЗавод ТГИнападающий561
128Мясников Максим ЮрьевичМОКБ Марс ГК Росатомзащитник541
129Горшков Александр АлександровичМоспроект-3нападающий461
130Гудков Илья Олегович Россельхозбанкнападающий451
131Анциферов Андрей Евгеньевич Моспроект-3защитник421
132Романюк Александр АркадьевичБанк СОЮЗполузащитник421
133Усков Сергей АлександровичРКСзащитник421
134Смирнов Павел ЕвгеньевичМоспроект-3нападающий411
135Кузьминых Дмитрий ИвановичМОКБ Марс ГК Росатомнападающий401
136Ступин Александр АлександровичРособоронэкспортзащитник401
137Земзюлин Роман Сергеевич Банк СОЮЗнападающий381
138Керсновский Александр Юрьевич ВНИИА 381
139Силич Антон Игоревич ВНИИА защитник361
140Гырбовецкий Евгений АнатольевичРоссельхозбанкнападающий351
141Чернаткин Сергей Леонидович НПО ПКРВполузащитник341
142Яцык Максим СергеевичПСБзащитник341
143Агафошин Александр АлександровичММЗ Авангардзащитник321
144Тырин Андрей ЮрьевичРособоронэкспортнападающий321
145Семченко Сергей Сергеевич Группа РЭЦзащитник311
146Денисов Сергей Евгеньевич HPE301
147Коженков Андрей ВикторовичБанк СОЮЗзащитник301
148Монахов Дмитрий ЮрьевичТСМнападающий301
149Нефедьев Антон НиколаевичBCLPнападающий301
150Лилье Андрей ВасильевичБанк СОЮЗполузащитник281
151Морозов Александр СергеевичРоссельхозбанкполузащитник281
152Панченков Антон АлександровичBCLPнападающий281
153Тарелкин Евгений НиколаевичТСМполузащитник281
154Чалый Сергей СергеевичПСБполузащитник281
155Гришин Александр АлександровичМАВ нападающий271
156Круглов Иван АлександровичВНИИА защитник271
157Артамонов Дмитрий СергеевичМоспроект-3вратарь261
158Мигаль Виталий АлександровичПСБполузащитник261
159Цейн Дмитрий ДмитриевичТСМнападающий261
160Шабашов Алексей Петрович МАВ защитник261
161Саскевич Павел ИвановичТСМнападающий241
162Щербанов Максим АнатольевичТСМзащитник241
163Соколов Денис Александрович Банк СОЮЗнападающий231
164Мельников Сергей Сергеевич Моспроект-3полузащитник221
165Бондаренко Александр НиколаевичРКСзащитник211
166Продченко Григорий Валентинович ВНИИА полузащитник201
167Соколовский Дмитрий Игоревич НИИ ТПзащитник201
168Салмов Егор Александрович BCLPполузащитник191
169Логвинов Никита КирилловичПСБнападающий181
170 Анисимов Алексей ЮрьевичHPEнападающий171
171Акопов Георгий СергеевичРосагролизинг-2нападающий171
172Боев Евгений Петрович ВНИИА защитник171
173Бородюк Геннадий ВасильевичГруппа Черкизовозащитник171
174Журавлев Илья ЕвгеньевичРосагролизинг-2защитник171
175Неминущий Андрей ВладимировичBCLPзащитник171
176Павлов Кирилл НиколаевичОнланта защитник171
177Суслов Юрий АлексеевичРосагролизингнападающий171
178Бердников Владимир СергеевичГруппа РЭЦвратарь161
179Владимиров Роман ВадимовичРосагролизинг-2защитник161
180Локтионов Сергей НиколаевичBCLPзащитник161
181Алеханов Роман ЮрьевичРКСполузащитник151
182Калашник Фёдор МихайловичОнланта полузащитник151
183Рачеев Александр ВасильевичВНИИА нападающий151
184Аванян Грант ВладимировичГАРАНТ Энергонападающий141
185Гордов Михаил Александрович ВНИИА нападающий141
186Гуренко Дмитрий Владимирович ДИТполузащитник141
187Колесниченко Кирилл Александрович ДИТнападающий141
188Максимов Роман ВячеславовичНТЦ Модульвратарь141
189Носков Александр Сергеевич Группа РЭЦполузащитник141
190Пронин Егор АлександровичРКСзащитник141
191Рагулин Иван АлександровичДом РФзащитник141
192Шибин Артем ВалерьевичРосагролизинг-2нападающий141
193Щербаков Илья ИгоревичНТЦ Модульнападающий141
194Батыралиев Равшан СооданбековияДИТнападающий131
195Кучмий Евгений АлександровичОнланта нападающий131
196Фоменко Никита Андреевич Россельхозбанквратарь131
197Куликов Олег Валерьевич Россельхозбанкполузащитник121
198Савин Дмитрий СергеевичНИИ ТПзащитник121
199Талыков Максим АлександровичHPEзащитник121
200Агинов Эренцен ВладимировичГУСБзащитник111
201Анисаров Евгений СпартаковичГруппа РЭЦвратарь111
202Гаппоев Георгий АлановичММЗ Авангардзащитник111
203Жихорев Александр НиколаевичБанк Россиивратарь111
204Козлов Никита АндреевичРосагролизингзащитник111
205Козлов Павел ЮрьевичПСБвратарь111
206Котасонов Денис АлександровичРосагролизинг-2защитник111
207Нетылькин Владимир ВладимировичБанк Россииполузащитник101
208Побединский Юрий МихайловичТСМзащитник101
209Телегин Игорь ВладимировичВНИИА полузащитник101
210Абдулаев Муртазали Абдулаевич МАВ защитник91
211Горячев Максим ГермановичМКБполузащитник91
212Лебедев Алексей СергеевичОРГХИМнападающий91
213Миронычев Даниил Романович ОРГХИМвратарь91
214Окунев Павел Александрович ОРГХИМнападающий91
215Щетинин Олег Юрьевич МКБполузащитник91
216Ионов Геннадий ВладимировичБанк Россиизащитник81
217Пазов Абузед Геннадьевич Рособоронэкспортполузащитник81
218Славин Дмитрий Сергеевич Группа РЭЦполузащитник81
219Степин Данила Николаевич НИИ ТПзащитник71
220Сычев Геннадий Геннадьевич Группа Черкизовополузащитник61
221Белянцев Сергей Николаевич300luxнападающий51
222Болонев Александр ВладимировичСириус-прокатзащитник51
223Войтулевич Иван ИгоревичРКСзащитник51
224Гришнов Кирилл СергеевичБМЗнападающий51
225Егоров Антон ИгоревичАЛРОСАзащитник51
226Калашников Игорь МихайловичМКБполузащитник51
227Кириченко Алексей СергеевичАЛРОСАнападающий51
228Лобанов Денис Викторович ОРГХИМнападающий51
229Никитин Денис ВалерьевичФора Банкнападающий51
230Омышев Михаил МарковичСириус-прокатзащитник51
231Бердников Дмитрий Сергеевич ИНТЕР РАО ЕЭС41
232Вальпуцкий Артем ВитальевичБанк СОЮЗполузащитник41
233Варцабо Владимир ВячеславовичПересвет полузащитник41
234Виерь Владислав ВитальевичГазпром Нефть41
235Голубев Алексей СергеевичАТЭкнападающий41
236Гулин Алексей ДмитриевичГазпром Нефть41
237Данилов Евгений ГеоргиевичФёст Логистикзащитник41
238Ефимов Андрей АлександровичИНТЕР РАО ЕЭСвратарь41
239Моисеев Андрей Александрович МКБнападающий41
240Никифоров Валерий ВладимировичCar&Goзащитник41
241Осипенков Виталий АндреевичФёст Логистикнападающий41
242Пакшин Игорь ВалерьевичГУСБнападающий41
243Памшев Роман ЛеонидовичИНТЕР РАО ЕЭСнападающий41
244Пономарев Виталий Олегович РОСАТОМ41
245Фомин Антон ВалерьевичИНТЕР РАО ЕЭСвратарь41
246Христофоров Андрей Витальевич Газпром Нефть41
247Шульц Эдуард Владимирович РОСАТОМ41
248Бадмаев Сергей Сергеевич Сбербанкполузащитник31
249Панов Александр МихайловичСбербанк31
250Гатауллин Руслан Рафаэлевич ТСМполузащитник11
251Фуруев Николай Владимирович МАВ вратарь01

Кто такой Дудченко Константин Викторович: профиль деятельности (ИНН 380500332772)

Согласно данным Единого государственного реестра юридических лиц, публикуемого ФНС России, Дудченко Константин Викторович (ИНН 380500332772) фигурирует в следующих юридических лицах.

  1. 1. Руководитель компании, генеральный директор
  2. 2. Учредитель Дудченко К.В.
  3. 3. Дудченко Константин Викторович и косвенно связанные лица

Данный ИНН выдан налоговой инспекцией Иркутской области .

Организации, перечисленные в связи с данным физическим лицом, зарегистрированы в следующих регионах:

  1. Санкт-Петербург (розничная торговля продуктами питания, напитками и табачными изделиями в специализированных магазинах; другое размещение)
  2. Иркутская область (розничная торговля алкогольными напитками, включая пиво, в специализированных магазинах)

Ранее Дудченко К.В. был указан в реквизитах организаций, зарегистрированных в Иркутская область : оптовая торговля напитками; розничная продажа алкогольных напитков, в том числе пива, в специализированных магазинах и еще 1 вид деятельности области.

Руководитель компании, генеральный директор

Дудченко К. В. является руководителем (лицо, имеющее право действовать от имени юридического лица без доверенности) организаций:

  1. ООО «КАПИТАЛ» (с 28.09.2018).
  2. ООО «БАРОККО СПБ» (с 31.05.2018).
  3. ООО «САНРАИЗ» (с 20.06.2016).

Ранее Дудченко К.В. был руководителем в организациях:

  1. ООО «АЛКИОН» (до 18.03.2021 *).
  2. ООО «ПОДСОЛНУХ» (до 11.09.2020 *; организация ликвидирована 11.09.2020).

Учредитель Дудченко К.В.

Дудченко К.В. является учредителем ООО «САНРАИЗ» с 20 июня 2016 года.

Ранее Дудченко К.В. был учредителем организаций:

  1. ООО «ПОДСОЛНУХ» (до 11.09.2020 *; организация ликвидирована 11.09.2020).
  2. ООО «ВОСТОКШИНА» (до 29.01.2021 *; организация ликвидирована 29.01.2021).

Дудченко Константин Викторович и косвенно связанные лица

По данным, содержащимся в ЕГРЮЛ, прослеживаются следующие косвенные связи с российскими организациями, их руководителями и учредителями. Обратите внимание, что ссылки могут носить формальный характер и не обязательно указывать на реальные контакты этих лиц. При установлении связи учитывалось не только совпадение фамилии, имени и отчества, но и ИНН физического лица.

Данные, представленные на данной странице, получены из официальных источников: Единого государственного реестра юридических лиц (ЕГРЮЛ), Государственного информационного ресурса бухгалтерской отчетности, сайта Федеральной налоговой службы (ФНС), Министерства финансов и Федеральная служба государственной статистики.

Рост Алексея Дудченко — Какой рост у Алексея Дудченко?

Алексей Дудченко родился 17 декабря 1984 года в России, российский гимнаст-акробатик.В 36 лет Алексей Дудченко рост сейчас недоступен. В ближайшее время мы обновим рост Алексея Дудченко.

Теперь мы узнаем биографию Алексея Дудченко, возраст, физические данные, знакомства / дела, семью и обновления карьеры. Узнайте, насколько Он богат в этом году и как Он тратит деньги? Также узнайте, как Он заработал большую часть собственного капитала в возрасте 36 лет?

Популярные Как Н/Д
Род занятий Н/Д
Возраст 36 лет
Знак Зодиака Стрелец
Дата рождения 17 декабря 1984 г.
День рождения 17 декабря
Место рождения Н/Д
Национальность Русский

Мы рекомендуем вам ознакомиться с полным списком известных людей, родившихся 17 декабря. Он является членом знаменитой группы Гимнаст в возрасте 36 лет .

Алексей Дудченко Вес и мерки

Физическое состояние
Вес Недоступно
Размеры тела Недоступно
Цвет глаз Недоступно
Краска для волос Недоступно

Статус знакомств и отношений

В настоящее время он не женат.Он ни с кем не встречается. У нас мало информации о прошлых отношениях Хе и его предыдущих помолвках. Согласно нашей базе данных, у него нет детей.

Семья
Родители Недоступно
Жена Недоступно
Родной брат Недоступно
Дети Недоступно

Алексей Дудченко Чистая стоимость

Его собственный капитал значительно вырос в 2018–2019 годах.Итак, сколько стоит Алексей Дудченко в возрасте 36 лет? Источником дохода Алексея Дудченко в основном является успешная гимнастка. Он из России. Мы оценили состояние, деньги, зарплату, доход и активы Алексея Дудченко.

Чистая стоимость в 2020 году 1 миллион долларов — 5 миллионов долларов
Заработная плата в 2019 году На рассмотрении
Чистая стоимость в 2019 году
В ожидании
Заработная плата в 2019 году На рассмотрении
Дом Недоступно
Автомобили Недоступно
Источник дохода Гимнастка

Социальная сеть Алексея Дудченко

Хронология

Он был одним из факелоносцев Ростова в эстафете огня Зимних Олимпийских игр 2014 года.

Алексей Дудченко (род. 17 декабря 1984 г.) — российский гимнаст, пятикратный призер чемпионатов мира по акробатической гимнастике. В паре с Константином Пилипчуком он является двукратным чемпионом мира в мужских парах, побеждая в 2012 и 2014 годах. Завоевывал серебряные медали в 2006, 2008 и 2010 годах.Вместе с Пилипчуком он также завоевал серебряную медаль на Всемирных играх 2009 года, золотую медаль на Всемирных играх 2013 года и является четырехкратным чемпионом Европы.

IDR2D идентифицирует воспроизводимые геномные взаимодействия

Abstract

Данные о взаимодействии хроматина из таких протоколов, как ChIA-PET, HiChIP и HiC, дают ценную информацию об организации генома и регуляции генов, но могут включать ложные взаимодействия, которые не отражают лежащую в основе биологию генома. Мы представляем обобщение метода IDR2D, называемого IDR2D, который идентифицирует воспроизводимые взаимодействия, общие для экспериментов по взаимодействию хроматина. IDR2D обеспечивает принципиальный набор взаимодействий и устраняет артефакты из отдельных экспериментов. Метод доступен в виде пакета Bioconductor для сообщества R, а также в виде онлайн-сервиса по адресу https://idr2d.mit.edu.

I. Введение

Метод невоспроизводимого коэффициента обнаружения [1] (IDR) идентифицирует надежный набор результатов, которые включают компонент сигнала, общий для двух повторных экспериментов.Метод IDR подобен коэффициенту ложных открытий (FDR) при проверке множественных гипотез, но вместо уменьшения накопления альфа-ошибки в одной повторности IDR количественно оценивает воспроизводимость результатов с использованием модели смеси копул с одним воспроизводимым и одним невоспроизводимым компонентом. IDR результата — это вероятность того, что он относится к невоспроизводимому компоненту. Это позволяет исключить результаты, которые, вероятно, относятся к компоненту невоспроизводимого шума, для последующего анализа. Оценка IDR геномных результатов была принята ENCODE [2] и рекомендуется для всех экспериментов ChIP-seq с повторами.IDR также использовался во многих проектах за пределами ENCODE [3–6].

Эксперименты по взаимодействию с хроматином, такие как ChIA-PET [7], HiChIP [8] и HiC [9], предоставляют важную информацию о структуре хроматина и регуляции генов, но сложность их результатов и шум выборки, присутствующий в их протоколах, делает принципиальной анализ полученных данных важен. Методы частоты ложных открытий (FDR) в одиночной повторности часто используются для идентификации взаимодействий хроматина, но могут оставаться вопросы о достоверности идентифицированных взаимодействий, поскольку они могут не наблюдаться в повторных экспериментах.

Здесь мы обобщаем IDR от одномерного анализа, выполняемого по одной координате генома, до анализа взаимодействий, которые идентифицируются в двух измерениях по паре координат генома. Мы называем этот расширенный метод невоспроизводимой скоростью обнаружения для двух измерений (IDR2D), и его можно легко применить к любому типу экспериментальных данных, который дает двумерные геномные результаты, которые допускают соответствующие метрики расстояния. Мы демонстрируем применение IDR2D к данным экспериментов ChIA-PET, HiChIP и HiC.

Как и IDR, IDR2D независимо ранжирует результаты каждой повторности. Этот рейтинг отражает достоверность результатов, при этом взаимодействия с высокой степенью достоверности находятся вверху, а взаимодействия с низкой степенью достоверности — внизу списка. На следующем этапе идентифицируются соответствующие взаимодействия между репликами. Говорят, что геномное взаимодействие из реплики 1 соответствует взаимодействию в реплике 2, если оба их якоря взаимодействия перекрываются (см. Рисунок 1C). После того, как соответствующие взаимодействия идентифицированы и неоднозначные сопоставления взаимодействий между репликами разрешены (см. уравнение 1 и рисунок 1D), IDR вычисляются для каждого повторного взаимодействия.

Рис. 1. IDR2D идентифицирует воспроизводимые геномные взаимодействия.

( A ) IDR2D является потенциальным этапом постобработки в конвейерах анализа данных для экспериментов ChIA-PET, HiChIP и HiC, которые проводились в повторах. Он совместим с рядом различных интерактивных вызывающих устройств, таких как ChIA-PET2, Mango и CID. ( B ) На этой схеме показаны пять этапов процедуры IDR2D. На шаге 1 данные подготавливаются для IDR-анализа, который включает в себя удаление взаимодействий на нестандартных хромосомах и подходящее преобразование столбца значений, которое будет лежать в основе ранжирования.На шаге 2 идентифицируются взаимодействия в реплике 1, которые перекрывают взаимодействия в реплике 2, а на шаге 3 путем разрешения неоднозначных случаев устанавливается однозначное соответствие между перекрывающимися взаимодействиями. После того, как это однозначное сопоставление установлено, на шаге 4 оцениваются уровни невоспроизводимых открытий для каждой пары взаимодействий. Наконец, на шаге 5 создаются диагностические графики. ( C ) Взаимодействие в реплике 1 (R1) назначается всем взаимодействиям в R2, для которых оба якоря взаимодействия перекрываются или находятся в пределах максимального промежутка друг от друга.( D ) Если более чем одно взаимодействие в R2 перекрывается с взаимодействием в R1, существует три способа разрешения этого неоднозначного сопоставления: выберите взаимодействие в R2 с (1) наименьшим расстоянием между точками привязки (шириной зеленого столбцы), (2) наибольшее относительное перекрытие (ширина зеленых столбцов, деленная на сумму ширин якорей), или (3) сумма взаимодействий с наименьшим рангом, которая отдает приоритет более значимым взаимодействиям.

Если взаимодействие x 1 в реплике 1 перекрывается с более чем одним взаимодействием в реплике 2, неоднозначное сопоставление разрешается путем выбора следующим образом: где — набор взаимодействий в повторе 2, который перекрывается с взаимодействием x 1 в повторе 1, а f (⋅, ⋅) — значение разрешения неоднозначности (ARV) между взаимодействием в повторе 1 и перекрывающееся взаимодействие в повторе 2. В зависимости от метода разрешения неоднозначности это значение соответствует геномному расстоянию между средними точками привязки (см. 1 на рисунке 1D), аддитивной инверсии относительного перекрытия привязки (см. 2 на рисунке 1D) или сумме рангов взаимодействия , где более значимые взаимодействия имеют более низкие ранги.

IDR2D используется в качестве последнего шага в рабочих процессах данных взаимодействия хроматина (см. рисунок 1A). Входными данными для IDR2D являются файлы геномных взаимодействий в формате BEDPE, где каждое геномное взаимодействие имеет связанную с ним оценку.Эта оценка используется для ранжирования взаимодействий и может быть основана на вероятности, например, на основе методов, основанных на MICC [10–12], или на основе эвристики. На рисунке 1B процедура IDR2D разбита на пять этапов.

II. Материалы и методы

A. IDR

IDR2D расширяет эталонную реализацию IDR в R от Qunhua Li [1]. Все наборы данных были проанализированы с помощью пакета IDR2D с параметрами по умолчанию. Мы использовали перекрытий в качестве метода разрешения неоднозначности и не допускали промежутков между перекрывающимися взаимодействиями ( макс.разрыв = 0L ). Применяемые преобразования значений зависели от метода вызова взаимодействия. Результаты не были чувствительны к начальным значениям среднего, стандартного отклонения, коэффициента корреляции или доли воспроизводимого компонента.

B. Наборы данных ChIA-PET

Мы использовали 17 наборов данных ChIA-PET, связанных с белковыми факторами, которые включают POL2RA, CTCF и RAD21 из выбранных типов клеток (дополнительная таблица S1). Наборы данных были загружены с портала проекта ENCODE (https://www.encodeproject.org/). Все файлы FASTQ обоих биологических повторов были предварительно обработаны и сопоставлены со сборкой генома hg19 с использованием шагов 1, 2 и 3 в программном обеспечении для анализа данных ChIA-PET Mango .

C. Наборы данных HiChIP

Данные FASTQ SMC1A HiChIP из клеток GM12878 [8] были загружены с портала NCBI GEO (GSE80820). Необработанные прочитанные файлы были проанализированы с помощью HiC-Pro [13], а взаимодействия впоследствии были вызваны CID и hichipper [14].

Д.Наборы данных HiC

Предварительно обработанные файлы матрицы контактов в формате .hic были загружены с портала NCBI GEO (подробности см. В дополнительной таблице S1) и проанализированы с помощью Straw , API извлечения данных для файлов .hic [15].

E. Конвейер Mango

Mango 1.2.1 [16] загружен с https://github.com/dphansti/mango. Дополнительно установили зависимости R 3.4.4, bedtools 2.26.0, macs2 (версия 2.1.1.20160309) [17] и -бабочка-выравнивание 1.2 [18]. Mango выполнялся с параметрами по умолчанию и были установлены флаги verboseoutput и reportallpairs . Для наборов данных, сгенерированных с помощью протокола мечения ChIA-PET Tn5, использовались дополнительные параметры, рекомендованные автором: -keepempty TRUE -maxlength 1000 -shortreads FALSE . Для последующего анализа IDR2D мы использовали столбец P в выходных файлах Mango, чтобы установить ранжирование взаимодействий.Этот столбец содержит нескорректированные p-значения, которые были преобразованы с помощью преобразования log.additive.inverse для соответствия семантике IDR столбца значений, где взаимодействия с большими значениями с большей вероятностью будут истинными взаимодействиями.

Файлы BEDPE, сгенерированные Mango после шага 3, также использовались конвейерами ChIA-PET2 и CID.

F. Трубопровод ЧИА-ПЭТ2

ЧИА-ПЭТ2 0.9.2 [11] получен с https://github.com/GuipengLi/ChIA-PET2.Для всех параметров использовались настройки по умолчанию, за исключением того, что начальный шаг был установлен на 4, чтобы начать анализ из файлов BEDPE, полученных из Mango. Ранжирование для анализа IDR2D было установлено по непреобразованному столбцу -log10(1-PostProb) , который является результатом MICC [10], байесовской смешанной модели, используемой внутри ChIA-PET2 и CID .

G. Конвейер CID

CID 1.0 [12] является частью программного пакета Java genomics GEM 3.4, который был загружен с http://groups.csail.mit.edu/cgs/gem/versions.html. Мы использовали параметры CID по умолчанию. Перед запуском MICC мы отфильтровали все взаимодействия, которые поддерживались только одним чтением PET. Как и в случае с ChIA-PET2, мы использовали непреобразованный столбец -log10(1-PostProb) для ранжирования взаимодействий в IDR2D.

H. Пакетная и веб-разработка

Процесс разработки пакета R поддерживался с использованием devtools . Мы использовали roxygen2 для встроенной документации функций и Knitr и R Markdown для виньеток пакетов.С пакетом R мы предоставляем независимую от платформы реализацию методов, представленных в этой статье. Для части пакета анализа HiC требуется пакет Python hic-straw [15], который представляет собой API извлечения данных для карт контактов HiC.

Веб-сайт был разработан на языке R с использованием среды реактивных веб-приложений блестящего от RStudio. Компоненты графического пользовательского интерфейса были предоставлены блестящими и блестящими BS , которые служат R-оболочкой для компонентов фреймворка веб-разработки Bootstrap.Очередь заданий анализа веб-сайта использует базу данных SQLite .

III. Результаты

A. IDR2D идентифицирует воспроизводимые компоненты экспериментов ENCODE ChIA-PET

Чтобы оценить производительность и полезность IDR2D, мы проанализировали данные считывания 17 экспериментов ChIA-PET, которые имели повторы (подробности см. В дополнительной таблице S1). Mango использовался для предварительной обработки данных, такой как удаление компоновщика, сопоставление чтения (через бабочку) и пиковый вызов (через macs2). Мы назвали взаимодействия тремя различными методами (ChIA-PET2, CID и Mango), а затем использовали IDR2D для выявления воспроизводимых взаимодействий в повторах. Количество идентифицированных взаимодействий сильно различается между тремя вызывающими взаимодействиями: в среднем CID идентифицирует больше всего, а Mango — наименьшее количество взаимодействий (см. рис. 2C). Общая воспроизводимость взаимодействий сильно зависит от эксперимента и в меньшей степени от используемого вызывающего взаимодействия. Например, эксперименты ChIA-PET Snyder.GM19239.RAD21 и Snyder.GM19240.RAD21 показывают плохую воспроизводимость для всех трех методов вызова взаимодействия.Идентифицируя воспроизводимый компонент в каждом из повторенных экспериментов, IDR2D помогает оценить общую воспроизводимость каждого эксперимента, а также воспроизводимость отдельных результатов, что, в свою очередь, дает информацию для выводов, сделанных на основе данных. Кроме того, его можно использовать, чтобы помочь квалифицировать новые экспериментальные протоколы для согласованных результатов.

Рис. 2. IDR2D-анализ 17 повторных экспериментов ChIA-PET идентифицирует воспроизводимые компоненты.

( A ) Диагностическая диаграмма рассеяния IDR геномных взаимодействий, вызванных CID, из повторных экспериментов ChIA-PET, нацеленных на RAD21 в клетках HepG2.На графике представлены повторяющиеся взаимодействия с их расчетным IDR (цвет) и их баллами в двух повторах (положение). Как и ожидалось, взаимодействия с низкими IDR, имеющие низкую вероятность принадлежности к невоспроизводимому компоненту, располагаются по диагонали (аналогичные оценки в обеих повторностях). ( B ) Аналогичен панели A , но отображает ранги взаимодействия вместо баллов (чем выше балл, тем ниже рейтинг). ( C ) Сравнение вызывающих взаимодействий ChIA-PET ChIA-PET2, CID и Mango в 17 экспериментах ChIA-PET.Значимый IDR < 0,05, высокозначимый IDR < 0,01, всего взаимодействий — количество взаимодействий в повторе 1.

Кроме того, мы использовали IDR2D для анализа результатов экспериментов с повторением HiChIP (см. дополнительные таблицы S5 и S6) . Подобно ChIA-PET, IDR2D может идентифицировать воспроизводимые взаимодействия HiChIP и выявлять плохо воспроизводимые эксперименты, что является ценной информацией для последующих этапов анализа.

B. Отображение геномных взаимодействий между повторными экспериментами ChIA-PET преимущественно однозначное

Подавляющее большинство взаимодействий в повторе 1, которые перекрываются с взаимодействиями в повторе 2, перекрываются только одним взаимодействием, что приводит к однозначному отнесению соответствующих повторных взаимодействий ( см. рисунок 3).Неудивительно, что количество неоднозначных сопоставлений (взаимодействия в реплике 1, которые перекрываются с более чем одним взаимодействием в реплике 2) увеличивается, когда увеличивается максимальный зазор , допустимое расстояние между якорями, которые считаются перекрывающимися. В среднем только 2,66% взаимодействий неоднозначны в случае нулевого max gap , тогда как это число увеличивается до 8,00% и 24,11% при максимальных промежутках 1000 и 5000 п. н. соответственно.

Рис. 3. Карты геномных взаимодействий между повторными экспериментами ChIA-PET преимущественно однозначны.

Подавляющее большинство взаимодействий в реплике 1, которые перекрываются с взаимодействиями в реплике 2, перекрываются только с одним взаимодействием, что приводит к однозначному отнесению соответствующих повторных взаимодействий (зеленые столбцы). Неудивительно, что количество неоднозначных отображений (взаимодействия в реплике 1, которые перекрываются с более чем одним взаимодействием в реплике 2) увеличивается, когда увеличивается максимально допустимый зазор, при этом допустимое расстояние между якорями по-прежнему считается перекрывающимся.

Между повторяющимися взаимодействиями, которые были вызваны с помощью CID, имеются более неоднозначные сопоставления (14,73% для CID, 9,90% для ChIA-PET2 и 10,14% для Mango). Мы ожидаем, что это связано с тем, что (1) CID в среднем вызывает значительно больше взаимодействий, чем ChIA-PET2 и Mango, и (2) взаимодействия, вызываемые с помощью CID, демонстрируют более широкий диапазон длин якорей, а более длинные якоря естественным образом увеличивают вероятность перекрытия.

C. Оценка воспроизводимости экспериментов HiC

При анализе пар экспериментов HiC с помощью IDR2D в качестве наблюдений используются блоки из контактных матриц HiC.Разрешение значений контактной матрицы обычно находится в диапазоне от 5 кбит/с (килопар оснований) до блоков 2,5 Мбит/с. С фиксированной сеткой наблюдений карты контактов найти соответствующие наблюдения во второй повторности несложно. Каждый блок в реплике 1 просто сопоставляется с блоком, охватывающим те же геномные области в реплике 2. Затем блоки ранжируются по количеству прочтений и анализируются с использованием той же процедуры, которая использовалась для данных ChIA-PET и HiChIP.

На рисунке 4 показаны результаты IDR2D для трех пар экспериментов HiC.Первая пара экспериментов HiC состоит из истинных повторных экспериментов в клетках GM12878 [19]. Вторая пара экспериментов была получена на фазированных мышиных эмбриональных фибробластах почек, где были доступны аллель-специфические чтения HiC [19] ( различных аллелей на рис. 4) [20], а третья пара экспериментов HiC была получена до и после сверхэкспрессия NSD2 (различные методы лечения) [21]. Идентификаторы GEO всех наборов данных перечислены в дополнительной таблице S1, а подробные результаты — в дополнительной таблице S7.Рисунок 4A дает обзор всех наборов данных и всех разрешений, показывая, что, как и ожидалось, воспроизводимость является самой высокой между истинными репликами и, как правило, выше при более низких разрешениях (большие блоки). На рисунке 4B показано распределение значений IDR для хромосомы 1 каждой из пар HiC при разрешении блоков 1 Мбит/с, 250 кбит/с и 10 кбит/с. Наибольшая доля воспроизводимых блоков находится между повторными экспериментами. Рисунки 4C-E представляют собой диаграммы рассеяния пар взаимодействия (соответствующие блоки в контактных матрицах) двух экспериментов, где цвет обозначает значение IDR пары взаимодействия.

Рис. 4. Анализ воспроизводимости экспериментов HiC.

( A ) Резюме результатов IDR2D на отдельных хромосомах трех пар экспериментов HiC, Истинные повторные эксперименты HiC (Lieberman. GM12878) сравниваются с IDR2D-анализом экспериментов HiC с разными аллелями (Lieberman.Patski) и различными обработками (Skok .НСД2). ( B ) Гистограммы распределения IDR значений IDR для всех блоков хромосомы 1 для трех пар экспериментов HiC. ( C ) Диаграммы рассеяния рангов блоков хромосомы 1 двух повторных экспериментов HiC, окрашенные IDR.( D ) Аналог C , для экспериментов HiC с отцовскими и материнскими аллелями. ( E ) Аналог C , для экспериментов HiC до и после сверхэкспрессии NSD2. Шкалы осей между диаграммами рассеяния не фиксируются.

В дополнение к вычислению значений IDR, IDR2D создает диагностические графики, которые интерпретируют общую воспроизводимость пары экспериментов HiC, а также определяют воспроизводимые части контактных матриц HiC для более целенаправленного последующего анализа.

IV. Обсуждение

IDR2D предлагает дополнительный способ оценки значимости результатов экспериментов по взаимодействию хроматина и обеспечивает основу для последующего анализа, такого как картирование генов-энхансеров, которое включает важную концепцию экспериментальной воспроизводимости.

Доступность

Реализация IDR2D облегчает интеграцию рабочего процесса с другими конвейерами анализа данных, а также доступна в Интернете по адресу https://idr2d.mit.edu. IDR2D реализован в R и входит в пакет R/Bioconductor (idr2d), поддерживая наблюдения как с одномерными, так и с двумерными геномными координатами.Реализация веб-сайта IDR2D предлагает несколько способов преобразования оценок в соответствии с требованиями IDR и сопоставления взаимодействий между репликами. Исходный код пакета R размещен на GitHub (https://github.com/gifford-lab/idr2d).

Вклад авторов

Концептуализация, Д.К.Г.; Методология, К.К.; Программное обеспечение, К.К.; Формальный анализ, К.К. и Ю.Г.; Расследование, К.К. и Ю.Г.; Ресурсы, DKG; Data Curation, К.К. и Ю.Г.; Написание — Оригинальный черновик, К.К.; Письмо — рецензирование и редактирование, К.К., Ю.Г. и Д.К.Г.; Визуализация, К.К.; Надзор, Д.К.Г.; Приобретение финансирования, D.K.G.

Финансирование

Национальные институты здравоохранения (NIH) предоставляют D.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.